有三種，分別是哺乳動物表達系統、酵母表達系統、昆蟲表達系統。

哺乳動物細胞表達系統能誘導高效表達，對目的蛋白進行正確折疊，并進行復雜糖基化修飾，生產的蛋白活性接近于天然蛋白，不需去除內毒素，但是實驗周期較長，操作復雜，成本高。

哺乳動物細胞表達系統的表達方式有兩種，瞬時轉染和構建穩定轉染的細胞系，應用于不同的研究需求。

哺乳動物細胞表達系統是基因工程藥物的生產平臺，適用于新基因的發現、蛋白質結構和功能的研究，是真核系統中可以單獨表達復雜系統的蛋白。

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