shRNA即短發(fā)卡RNA（short hairpin RNA），包含一段緊密發(fā)卡環(huán)結(jié)構(gòu)，常被用于RNA干擾沉默靶基因的表達(dá)。

siRNA是小干擾RNA，是一種雙鏈RNA，3’端含有兩個突出的非配對堿基。siRNA可以激活RNA干擾，信使鏈被移除，向?qū)ф溡龑?dǎo)對靶標(biāo)RNA的切割和降解。

雖然siRNA和shRNA都可用于蛋白沉默，但它們的作用機(jī)制有所不同。

shRNA是siRNA或者miRNA的前體，shRNA在轉(zhuǎn)錄后可以從細(xì)胞核轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)，在細(xì)胞質(zhì)中其環(huán)結(jié)構(gòu)被Dicer酶切割，釋放siRNA。

siRNA的信使鏈被移除，向?qū)ф溡龑?dǎo)RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體（RISC）對靶標(biāo)RNA進(jìn)行切割和降解，實現(xiàn)特定mRNA翻譯的抑制。

shRNA的作用方式是利用載體把shRNA導(dǎo)入細(xì)胞核內(nèi)，在某些情況下，載體可以穩(wěn)定地整合到基因組中，可以被傳遞到子代細(xì)胞中去，從而使基因的沉默可被遺傳。

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